Modelos de mixturas en el análisis de datos de single-cell RNA-seq.

M. T. León Mendoza, G. Ayala Gallego, J. Domingo Esteve, E. Durá Martínez, M. J. Garzón Garzón

La distribución binomial negativa ha sido ampliamente utilizada en la literatura para modelar los datos de recuento obtenidos a partir de experimentos de secuenciación de célula única (scRNA-Seq) por su capacidad para recoger la sobredispersión de dichos conteos. Sin embargo, esta modelización no siempre es adecuada, por ejemplo cuando se observa un exceso de ceros, y se han propuesto otros como el ZINB ( Zero Inflated Negative Binomial) que es una mixtura de una binomial negativa y una distribución de Dirac (en cero). Nosotros proponemos una modelización de los recuentos como mixtura de binomiales negativas. Hemos programado un algoritmo EM y realizado experimentos computacionales, obteniendo resultados prometedores.

Keywords: Mixturas, Binomial negativa,scRNA-Seq

SDDS2 Data analysis for health decisions
June 11, 2025  10:30 AM
Auditorio 2. Leandre Cristòfol

G. Ayala Gallego, J. Domingo Esteve, M. T. León Mendoza, M. J. Garzón Garzón, A. Riffo-Campos

D. García de Vicuña Bilbao, A. M. Anaya Arenas, J. Ortmann, Á. Ruiz, F. Mallor Giménez

E. Pérez Bernabeu, S. Ortuño Miquel, N. Serrano-Gadea, M. Escorial, P. Carracedo Garnateo, S. Oltra Crespo, A. M. Peiró, P. Miró i Martínez